​​​​ La EGYPTAIR ha sviluppato accordi di codeshare con le seguenti compagnie aeree, per offrire una scelta più ampia di destinazioni e per accrescere i vantaggi e il valore dei prodotti per i clienti. I voli codeshare possono essere gestiti sia dalla EGYPTAIR che dalla compagnia aerea partner di codeshare. Essi sono caratterizzati da due numeri di volo – il numero di volo della EGYPTAIR e il numero di volo della compagnia aerea in codeshare che gestisce il servizio.